山門湿原がいつできたのかの解答は、湿原内部の堆積物中に含まれる火山灰によってきめられます。ここには、姶良（あいら）【AT】火山灰と、アカホヤ火山灰とがみつかっています。このうち姶良火山灰は、今から2.5万年前に九州の鹿児島から飛来したものです。
　またアカホヤ火山灰は約6300年前に鹿児島のさらに南の喜界島（きかいじま）から飛んできたものです。